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功能性饮料的基本生产工艺和相同类型的一般饮料的基本工艺流程是大致相同的，如功能性碳酸饮料的生产工艺也同样包括水处理、二氧化碳处理、调配和灌装四大系统，乳性功能饮料的生产工艺基本相同于乳饮料的工艺等，但由于功能饮料的原料众多，特性各异，所以其提取、调制、后处理等工艺过程也就各不相同。

植物性原料中功能成分一般采取萃取法来提取。萃取法是将其有效成分先溶解于溶剂中，从而使其得到部分或完全分离的一种方法。

在进行萃取操作时一般应注意以下几点。

1、 首先要正确选择溶剂；

2、 在用液体萃取液体时，两种液体的密度相差要大，以便于分离，同时要加以搅拌，以增加液体之间的接触面积；

3、 萃取固体原料时，可采用多次或连续长时间萃取；

4、 为提高萃取速度，可采用适当的粉碎、加速液体流动速度、搅拌、鼓入压缩空气等方法；

5、 要选择合适的温度。

萃取法不但能分离有效成分还可以 排除某些有害成分。而超临界二氧化碳萃取等现代萃取法，进一步完善了功能饮料性有效成分的提取技术。

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